10º Reunión GMI: Secuenciación Genómica
GMI desarrolla la base de datos genómica epidemiológico más grande y completa del mundo, para la identificación global de microorganismos. Es una plataforma de almacenamiento de datos mediante la tecnología de secuenciación de genoma completo (WGS) de los microorganismos, para la identificación de genes relevantes y para la comparación de los genomas, y así detectar brotes y patógenos emergentes.
La base de datos tiene dos tipos de información: 1) información genómica de microorganismos, ligado a 2) metadatos de los microorganismos tales como datos epidemiológicos. La base de datos busca incluir todos los géneros de microorganismos: bacterias, virus, parásitos y hongos.
Puede consultar el video https://www.youtube.com/watch?v=xcK76ARNNdw
En la era previa a que WGS madurara, científicos usaban diferentes técnicas de perfilamiento de ADN tales como PCR y PFGE y MLST para identificar genotipos de microorganismos y diagnosticar los sub-tipos. Sin embargo, en muchos de los casos de científicos encontraban que estas técnicas pre-WGS tenían grandes inconvenientes tales como dificultades en la estandarización entre países y entre laboratorios dentro de los países. Además, estas técnicas pre-WGS eran generalmente laboriosas y tardadas, además de requerir personal altamente capacitado y equipo caro y, en general, un proceso relativamente caro. WGS supera muchos de estos problemas.
Esto se logra alimentando información de grupos de muestras microbiológicas en una base de datos genómica global, y comparando a través de los llamados procedimientos BLAST a los genomas en la base de datos. La base de datos entonces devuelve al remitente con información sobre los microorganismos presentes en la muestra y la importante información clínica y epidemiológica como la ubicación global de clones similares, así como opciones de tratamiento.
De esta manera, la base de datos acerca la inequívoca ‘identificador Global’ para microorganismos que microbiólogos siempre han buscado, y que permite un tratamiento personalizado así como sistemas de tiempo real para la vigilancia global de enfermedades infecciosas y general microorganismos específicos.
Para lograr esto, los grupos de trabajo del GMI se reúnen periódicamente desde 2011. Esta ocasión la 10ª. Reunión Técnica del GMI se realizará en Cabo San Lucas, Baja California Sur.
En su décima edición, esta reunión de GMI es la primera a realizarse en América Latina y es una gran oportunidad para ampliar contactos GMI en esta región. La reunión representa la unidad GMI hacia un debate global sobre el uso futuro de Next Generation Sequencing (NGS) en apoyo de Microbiología en la sinergia de la industria alimentaria, salud pública y el medio ambiente combinado.
La reunión es también un esfuerzo para llegar a los científicos, entidades reguladoras y las industrias relevantes en los países en desarrollo, y así crear conciencia sobre los beneficios potenciales de Secuenciación de Genoma Completo (WGS), en países donde la salud pública y laboratorios microbiológicos se están desarrollando rápidamente.
Para mayor información acerca del GMI visite http://www.globalmicrobialidentifier.org/
Desde el Comité directivo del GMI nos complace en invitarlo a la 10ª. Reunión técnica del Global Microbial Identifier (GMI), asi como al foro “Tecnología de Secuenciación del Genoma Completo e Inocuidad de Frutas y Hortalizas: Pruebas de ADN bacteriano patógeno y su significado”, a celebrarse consecutivamente, del 15 al 19 de mayo de 2017, en el Sheraton Grand Hacienda del Mar de Cabo San Lucas.
Para mayor información de 10th Global Microbial Identifier (GMI) Technical Meeting, lo invitamos a visitar la página de internet http://www.globalmicrobialidentifier.org/News-and-Events/10th-Meeting-on-GMI; donde está disponible toda la información relativa al evento, así como el material recopilado en anteriores ediciones.
Respecto al Foro “Tecnología de Secuenciación del Genoma Completo e inocuidad de frutas y hortalizas: Pruebas de ADN bacteriano patógeno y su significado”, puede visitar la página http://www.inoquotech.mx