Nueva York: Nueva base de datos de edición del genoma vegetal

Mediante el uso de herramientas de edición genomica recientemente desarrolladas como CRISPR / Cas, los científicos de plantas han podido descubrir las funciones de tantos genes de plantas. Si bien estos estudios podrían conducir a la creación de cultivos con rasgos mejorados, los investigadores primero necesitan una buena manera de realizar un seguimiento de las cantidades cada vez mayores de datos resultantes.

Para satisfacer esta necesidad, los investigadores del Instituto Boyce Thompson han desarrollado la Base de datos de edición del genoma de la planta (PGED por sus siglas en ingles) para que sea un depósito central para la gestión eficiente de los datos de mutantes de las plantas, así como para proporcionar una plataforma para compartir los datos y mutantes con la comunidad de investigación.

La esperanza máxima es que PGED conduzca a un uso más eficiente de los recursos al reducir experimentos duplicados innecesarios y catalizar colaboraciones entre instituciones de investigación. Para ayudar a comunicar sobre la creación de la base de datos, los investigadores publicaron recientemente una convocatoria para el envío de datos a PGED en la revista Molecular Plant.

“Hemos utilizado CRISPR/Cas para hacer más de 430 líneas diferentes, y eso es solo en tomate. El problema principal inicialmente fue cómo hacer un seguimiento de todas ellas, por lo que esa fue la motivación principal detrás de la creación de la base de datos”, según a Greg Martin de BTI, quien fue el co-autor corresponsal junto con Zhangjun Fei de BTI. “Muchos laboratorios de biología vegetal están investigando CRISPR/Cas en estos días, y todos enfrentarán este problema”.

Fuente: www.freshplaza.com